工藤新一是全國著名的高中生偵探，在一次追查黑衣人犯罪團伙時不幸被團伙成員發現，擊暈后喂了神奇的藥水，工藤新一變回了小孩！新一找到了經常幫助他的阿笠博士，博士為他度身打造不少間諜武器。為了防止犯罪團伙對他進行報復，新一決定隱姓埋名，暗中追查他們，希望能得到解藥。一日，新一 的女友毛利蘭來到了阿笠博士的家尋找男友的下落，被小蘭撞見的新一情急之下編造了自己名叫江戶川柯南，隨后柯南寄居在了小蘭家。小蘭的父親毛利小五郎是一名私家偵探，新一可以籍著和他一起四出辦案一起追查黑夜人的下落。柯南在小學認識步美等小學生，他們一起組織了一個少年偵探團，向罪犯宣戰！
么啦
第二季的各個勢力基本都登場了，各自角逐比第一季激烈許多。魏瑪體制擁護者/保皇派/托派/蘇聯勢力/納粹/黑幫/商界/共產黨…根本數不過來，人物的動機是隱藏的，行為模式是模糊不定，性格是鮮明的。這么多派別的zz斗爭真是前所未見，敘事線索也太多了，金子/圣血日/黑色國防軍/本達案/神父案…湯姆提克威敘事功力也太強了！感悟就是 不關心zz的后果就是會被壞人當刀子使；本達死了也太讓人難過了嗚；沃爾特這個反派壞得挺可愛的（至少比第三季溫特好多了）；巴比倫柏林的意思就是在風雨飄搖的柏林生存就如同不同信仰的人們互相欺騙互相利用建統天塔一樣吧